MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 10610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003064	GC	3	6	54138	54143	0 %	0 %	50 %	50 %	159186474
1002	NC_003064	GTCCA	2	10	54212	54221	20 %	20 %	20 %	40 %	159186474
1003	NC_003064	TCACC	2	10	54243	54252	20 %	20 %	0 %	60 %	159186474
1004	NC_003064	GGCG	2	8	54320	54327	0 %	0 %	75 %	25 %	159186474
1005	NC_003064	GCG	2	6	54348	54353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186474
1006	NC_003064	T	6	6	54385	54390	0 %	100 %	0 %	0 %	159186474
1007	NC_003064	GCTTT	2	10	54405	54414	0 %	60 %	20 %	20 %	159186474
1008	NC_003064	TCC	2	6	54431	54436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186474
1009	NC_003064	CGC	2	6	54483	54488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186474
1010	NC_003064	GCG	2	6	54527	54532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186474
1011	NC_003064	TCG	2	6	54575	54580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186474
1012	NC_003064	GCG	2	6	54587	54592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186474
1013	NC_003064	TTC	2	6	54598	54603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186474
1014	NC_003064	GTC	2	6	54613	54618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186474
1015	NC_003064	CAG	2	6	54631	54636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186474
1016	NC_003064	CTCC	2	8	54708	54715	0 %	25 %	0 %	75 %	159186474
1017	NC_003064	TTG	2	6	54761	54766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186474
1018	NC_003064	GCC	3	9	54808	54816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186474
1019	NC_003064	GA	3	6	54907	54912	50 %	0 %	50 %	0 %	159186474
1020	NC_003064	T	6	6	55059	55064	0 %	100 %	0 %	0 %	159186474
1021	NC_003064	CCGG	2	8	55164	55171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_003064	CCAA	2	8	55309	55316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_003064	CGA	2	6	55389	55394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003064	GCA	2	6	55420	55425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_003064	GA	3	6	55427	55432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003064	ACG	2	6	55545	55550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1027	NC_003064	TGT	2	6	55551	55556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186475
1028	NC_003064	ATTCGA	2	12	55620	55631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159186475
1029	NC_003064	GCT	2	6	55643	55648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1030	NC_003064	GTC	2	6	55702	55707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1031	NC_003064	CG	3	6	55715	55720	0 %	0 %	50 %	50 %	159186475
1032	NC_003064	AGA	2	6	55751	55756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186475
1033	NC_003064	GAG	2	6	55813	55818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186475
1034	NC_003064	GCG	2	6	55819	55824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186475
1035	NC_003064	AGA	2	6	55825	55830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186475
1036	NC_003064	CGG	2	6	55846	55851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186475
1037	NC_003064	GAG	3	9	55879	55887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186475
1038	NC_003064	ACG	2	6	55899	55904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1039	NC_003064	GGC	2	6	55922	55927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186475
1040	NC_003064	CGA	2	6	55944	55949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1041	NC_003064	TCC	2	6	55953	55958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186475
1042	NC_003064	GTC	2	6	55969	55974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1043	NC_003064	TCG	2	6	56021	56026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186475
1044	NC_003064	AGA	2	6	56064	56069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186475
1045	NC_003064	GTG	2	6	56157	56162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186475
1046	NC_003064	AGA	2	6	56175	56180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186475
1047	NC_003064	CGG	2	6	56194	56199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186475
1048	NC_003064	CAA	2	6	56232	56237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186475
1049	NC_003064	TCA	2	6	56262	56267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003064	GAC	2	6	56292	56297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186476
1051	NC_003064	CG	3	6	56313	56318	0 %	0 %	50 %	50 %	159186476
1052	NC_003064	GCC	2	6	56337	56342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186476
1053	NC_003064	CGA	2	6	56414	56419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186476
1054	NC_003064	CGG	2	6	56444	56449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186476
1055	NC_003064	CTA	2	6	56680	56685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_003064	TGG	2	6	56699	56704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003064	CGT	2	6	56729	56734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_003064	TCA	2	6	56862	56867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_003064	CAGC	2	8	56979	56986	25 %	0 %	25 %	50 %	16119286
1060	NC_003064	CGC	2	6	56998	57003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119286
1061	NC_003064	TGC	2	6	57022	57027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1062	NC_003064	CAA	2	6	57055	57060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119286
1063	NC_003064	ATC	2	6	57086	57091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119286
1064	NC_003064	GCC	2	6	57104	57109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119286
1065	NC_003064	CCGATA	2	12	57114	57125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16119286
1066	NC_003064	CAT	2	6	57157	57162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119286
1067	NC_003064	GCC	2	6	57176	57181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119286
1068	NC_003064	AAC	2	6	57245	57250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119286
1069	NC_003064	CTC	2	6	57367	57372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119286
1070	NC_003064	CAA	2	6	57391	57396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119286
1071	NC_003064	CG	3	6	57410	57415	0 %	0 %	50 %	50 %	16119286
1072	NC_003064	CAG	2	6	57462	57467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1073	NC_003064	CG	3	6	57532	57537	0 %	0 %	50 %	50 %	16119286
1074	NC_003064	GATC	2	8	57571	57578	25 %	25 %	25 %	25 %	16119286
1075	NC_003064	ATG	2	6	57734	57739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119286
1076	NC_003064	GTT	2	6	57791	57796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119286
1077	NC_003064	CGG	2	6	57835	57840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119286
1078	NC_003064	CAT	2	6	57853	57858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119286
1079	NC_003064	TGC	2	6	57886	57891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1080	NC_003064	GCA	2	6	57911	57916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1081	NC_003064	CAA	2	6	57967	57972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119286
1082	NC_003064	GAC	2	6	58072	58077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1083	NC_003064	CAC	2	6	58096	58101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119286
1084	NC_003064	TGC	2	6	58168	58173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119286
1085	NC_003064	CG	3	6	58179	58184	0 %	0 %	50 %	50 %	16119286
1086	NC_003064	GAA	2	6	58187	58192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119286
1087	NC_003064	CGG	2	6	58231	58236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_003064	TGA	2	6	58309	58314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186477
1089	NC_003064	TTTCC	2	10	58382	58391	0 %	60 %	0 %	40 %	159186477
1090	NC_003064	GAC	2	6	58469	58474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186477
1091	NC_003064	CGC	2	6	58526	58531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186477
1092	NC_003064	CTG	2	6	58563	58568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186477
1093	NC_003064	TTC	2	6	58582	58587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186477
1094	NC_003064	ATGGC	2	10	58648	58657	20 %	20 %	40 %	20 %	159186477
1095	NC_003064	CG	3	6	58804	58809	0 %	0 %	50 %	50 %	159186477
1096	NC_003064	GCA	2	6	58821	58826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186477
1097	NC_003064	GGC	2	6	58836	58841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186477
1098	NC_003064	T	6	6	58898	58903	0 %	100 %	0 %	0 %	159186477
1099	NC_003064	TGA	2	6	58954	58959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186477
1100	NC_003064	CCT	2	6	59000	59005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186477
1101	NC_003064	CTG	2	6	59073	59078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186477
1102	NC_003064	CAT	2	6	59105	59110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186477
1103	NC_003064	CTT	2	6	59146	59151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119288
1104	NC_003064	CTG	2	6	59176	59181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1105	NC_003064	CTA	2	6	59235	59240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119288
1106	NC_003064	GC	4	8	59275	59282	0 %	0 %	50 %	50 %	16119288
1107	NC_003064	CTG	2	6	59311	59316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1108	NC_003064	GCT	2	6	59346	59351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1109	NC_003064	GGC	2	6	59373	59378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119288
1110	NC_003064	GCA	2	6	59425	59430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1111	NC_003064	TGA	2	6	59444	59449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119288
1112	NC_003064	GCT	2	6	59502	59507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1113	NC_003064	CGC	2	6	59553	59558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119288
1114	NC_003064	CTT	2	6	59559	59564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119288
1115	NC_003064	GGC	2	6	59607	59612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119288
1116	NC_003064	ATGG	2	8	59617	59624	25 %	25 %	50 %	0 %	16119288
1117	NC_003064	CAT	2	6	59652	59657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119288
1118	NC_003064	CT	3	6	59693	59698	0 %	50 %	0 %	50 %	16119288
1119	NC_003064	GGAAT	2	10	59712	59721	40 %	20 %	40 %	0 %	16119288
1120	NC_003064	TCG	2	6	59738	59743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119288
1121	NC_003064	GCAA	2	8	59750	59757	50 %	0 %	25 %	25 %	16119288
1122	NC_003064	TTC	2	6	59861	59866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119288
1123	NC_003064	CTTC	2	8	59880	59887	0 %	50 %	0 %	50 %	16119288
1124	NC_003064	TGG	2	6	59888	59893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119288
1125	NC_003064	AAT	2	6	59933	59938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119288
1126	NC_003064	CGG	2	6	59977	59982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119289
1127	NC_003064	ACCGCC	2	12	60020	60031	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	16119289
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1132	NC_003064	GC	3	6	60225	60230	0 %	0 %	50 %	50 %	16119289
1133	NC_003064	TTG	2	6	60303	60308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119289
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1234	NC_003064	CTC	2	6	65380	65385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1250	NC_003064	GC	3	6	66247	66252	0 %	0 %	50 %	50 %	159186480
1251	NC_003064	CGA	2	6	66304	66309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186480
1252	NC_003064	TCA	2	6	66322	66327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186480
1253	NC_003064	GCGAG	2	10	66361	66370	20 %	0 %	60 %	20 %	16119296
1254	NC_003064	GCC	2	6	66382	66387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119296
1255	NC_003064	TG	3	6	66430	66435	0 %	50 %	50 %	0 %	16119296
1256	NC_003064	ACC	2	6	66484	66489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119296
1257	NC_003064	CATGAC	2	12	66501	66512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16119296
1258	NC_003064	GATGAA	2	12	66552	66563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16119296
1259	NC_003064	TC	3	6	66575	66580	0 %	50 %	0 %	50 %	16119296
1260	NC_003064	AGC	2	6	66595	66600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119296
1261	NC_003064	CAC	2	6	66603	66608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119296
1262	NC_003064	TCG	2	6	66646	66651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119296
1263	NC_003064	ACGCTG	2	12	66699	66710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16119296
1264	NC_003064	GCG	2	6	66781	66786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119296
1265	NC_003064	GGGTC	2	10	66881	66890	0 %	20 %	60 %	20 %	16119296
1266	NC_003064	CGA	2	6	67046	67051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119296
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1270	NC_003064	TGA	2	6	67331	67336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119296
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1272	NC_003064	CTGC	2	8	67391	67398	0 %	25 %	25 %	50 %	16119296
1273	NC_003064	GGT	2	6	67416	67421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119296
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1280	NC_003064	TCG	2	6	67714	67719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119296
1281	NC_003064	AGA	2	6	67732	67737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119296
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1286	NC_003064	CTGA	2	8	68122	68129	25 %	25 %	25 %	25 %	16119297
1287	NC_003064	TCA	2	6	68130	68135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119297
1288	NC_003064	GGC	2	6	68153	68158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119297
1289	NC_003064	ATGCCG	2	12	68162	68173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16119297
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1291	NC_003064	ACG	2	6	68249	68254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119297
1292	NC_003064	GCC	2	6	68306	68311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119297
1293	NC_003064	GTG	2	6	68354	68359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119297
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1320	NC_003064	CGA	3	9	69491	69499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119298
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1323	NC_003064	CGGG	2	8	69582	69589	0 %	0 %	75 %	25 %	16119298
1324	NC_003064	GAAC	2	8	69641	69648	50 %	0 %	25 %	25 %	16119298
1325	NC_003064	GTCCA	2	10	69666	69675	20 %	20 %	20 %	40 %	16119298
1326	NC_003064	CCG	2	6	69704	69709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119298
1327	NC_003064	GAA	2	6	69722	69727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119298
1328	NC_003064	GA	3	6	69757	69762	50 %	0 %	50 %	0 %	16119298
1329	NC_003064	GCG	2	6	69862	69867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NC_003064	CACTT	2	10	69882	69891	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1331	NC_003064	TGG	2	6	69916	69921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1332	NC_003064	CGAT	2	8	69998	70005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1333	NC_003064	CAGGG	2	10	70006	70015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1334	NC_003064	GCA	2	6	70061	70066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119299
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1351	NC_003064	CTT	2	6	70923	70928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119299
1352	NC_003064	AAT	2	6	70934	70939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119299
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1361	NC_003064	TCC	2	6	71633	71638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119300
1362	NC_003064	CCA	2	6	71654	71659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119300
1363	NC_003064	TAT	2	6	71860	71865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1364	NC_003064	TGA	2	6	71899	71904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186481
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1368	NC_003064	GC	3	6	72031	72036	0 %	0 %	50 %	50 %	159186481
1369	NC_003064	CGG	2	6	72053	72058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186481
1370	NC_003064	GCG	2	6	72186	72191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186481
1371	NC_003064	CCGTAT	2	12	72251	72262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159186481
1372	NC_003064	CG	3	6	72274	72279	0 %	0 %	50 %	50 %	159186481
1373	NC_003064	CGG	2	6	72304	72309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186481
1374	NC_003064	GCT	2	6	72340	72345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186481
1375	NC_003064	GGA	2	6	72494	72499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186481
1376	NC_003064	CGA	2	6	72548	72553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186481
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1378	NC_003064	CGT	2	6	72576	72581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186481
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1380	NC_003064	GAT	2	6	72710	72715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186481
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1382	NC_003064	GCC	2	6	72732	72737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186481
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